Nos especializamos en la identificación animal por ADN, la detección de patógenos, el análisis de marcadores moleculares asociado a características de interés del sector, el desarrollo de nuevos productos, y al genotipado de baja, mediana y alta densidad.
SECTOR Animal
Array de camarones / Tilapia
Axiom Multiespecies camarones y Tilapia Genotyping Array (Axiom TilShrv1) fue diseñado en colaboración con João Campos y Jose Fernando Garcia de Trigene, Brasil, con el apoyo financiero de PIPE-FAPESP. La matriz contiene 60,886 SNP de tilapia y 6,453 SNP de camarón.
Contenido de camarones:
• Contiene 6453 SNP de camarones
• Marcadores seleccionados del genoma de L. vannamei a partir de un conjunto de datos de más de 350 000 variantes putativas (1,2)
• Marcadores espaciados uniformemente
Contenido de tilapia:
• Contiene 60,886 SNP de tilapia
• Doce cepas diferentes de tilapia del Nilo desde muestras africanas silvestres hasta GIFT, Chitralada, Stirling y otras cepas de cultivo obtenidas de diferentes orígenes en Brasil y América del Norte, lo que representa la mayor parte de la variabilidad de la tilapia del Nilo en el mundo
• Un total de 16 millones de variantes identificadas después de las lecturas de mapeo de 158 muestras al genoma de referencia de la tilapia del Nilo (GCF001858045.2 O. niloticus UMD-NMBU)
• Después del filtrado, más de 2 millones de SNP bialélicos investigados para su inclusión en la matriz
• Se seleccionaron SNP altamente polimórficos sin polimorfismos adyacentes.
• El conjunto final de SNP tuvo una distancia promedio de 14 kbp en los 22 grupos de ligamiento y alta frecuencia de alelos, y solo unos pocos tenían> 5% de SNP con una frecuencia de alelos menor de 0.05