Microarreglos / genotipado
En Genexa contamos con la primer plataforma a nivel local para el genotipado de mediana o alta densidad de marcadores de tipo SNP de la firma ThermoFisher.
La plataforma GeneTitan, Affymetrix permite analizar miles de sitios en el genoma a través de microarreglos comerciales para diferentes aplicaciones.
En Agrigenómica las principales aplicaciones son:
Array de fresa
Axiom Strawberry Genotyping Array fue diseñado a través del Programa de Diseño de Expertos de Affymetrix en colaboración con el consorcio International RosBREED SNP que abarca múltiples naciones, estados e instituciones dedicadas a la mejora genética de cultivos rosáceos. * La matriz ofrece una cobertura de todo el genoma de SNP polimórficos en todo el territorio. Híbrido cultivado de fresa de jardín ( Fragaria ananassa ).
Características de Axiom Strawberry Genotyping Array:
• Contenido completo: 95,062 SNP e indeles derivados de cultivares octoploides y diploides, que incluyen:
- 1,761 SNP
multialélicos - 3,751 SNP derivados de cultivares diploides; los marcadores restantes se derivan de cultivares octoploides
• Varias variedades representadas:El descubrimiento de SNP se facilitó con un panel de germoplasma de mejoramiento diverso en todo el mundo que incluyó: - Plántulas Holiday, Korona y F1 del cruce Holiday x Korona
- Dos progenitores diploides probables, Fragaria mandschurica, F. iinumae
- Una F. vesca diploide conocida
