En Genexa contamos con la primer plataforma a nivel local para el genotipado de mediana o alta densidad de marcadores de tipo SNP de la firma ThermoFisher.

La plataforma GeneTitan, Affymetrix permite analizar miles de sitios en el genoma a través de microarreglos comerciales para diferentes aplicaciones.

En Agrigenómica las principales aplicaciones son:

Array Trigo

Las matrices de genotipado Axiom Wheat HD se diseñaron a través del programa de diseño experto de Affymetrix en una colaboración dirigida por el Dr. Keith Edwards, líder del proyecto y profesor de genómica funcional de cereales en la Facultad de Ciencias Biológicas y miembro del Instituto Cabot de la Universidad de Bristol. *

Este producto es parte de un conjunto de dos matrices. Se puede acceder a Array Plate B en 550492 Axiom ™ Wheat HD Genotyping Arrays .

Las matrices se diseñaron a través de un programa de premejoramiento del sector público dedicado a acelerar el mejoramiento genético de las variedades modernas de trigo. Seleccione uno de los dos formatos:
• Axiom; Wheat HD Genotyping Array, una herramienta de investigación de alta densidad con 817,000 SNP en un conjunto de dos arreglos en el formato de placa de 96 arreglos
• Axioma; Wheat Breeder's Genotyping Array, que incluye 35,000 SNP para líneas de trigo de élite en todo el mundo en el formato de placa de 384 arreglos. Los

marcadores en estos arreglos se pueden consultar en el sitio web de CerealsDB ( http://www.cerealsdb.uk.net/ ). Esta es una base de datos con capacidad de búsqueda que fue creada por el grupo de Genómica Funcional de la Universidad de Bristol, Reino Unido, con el propósito de poner la información de SNP a disposición de la comunidad mundial del trigo. Se actualiza periódicamente y contiene:

• Estadísticas SNP: ubicación del mapa o código contig, secuencias flanqueantes de 120 pb. La puntuación MAF y PIC se proporcionan para los SNP en la matriz de genotipado de Axiom Wheat Breeder
• Comparación de variedades: seleccione dos o más variedades de trigo para ver los SNP en común o los SNP que son diferentes entre ellos