Microarreglos / genotipado
En Genexa contamos con la primer plataforma a nivel local para el genotipado de mediana o alta densidad de marcadores de tipo SNP de la firma ThermoFisher.
La plataforma GeneTitan, Affymetrix permite analizar miles de sitios en el genoma a través de microarreglos comerciales para diferentes aplicaciones.
En Agrigenómica las principales aplicaciones son:
Array Pollos
Axiom Chicken Genotyping Array se desarrolló en colaboración con las principales instituciones académicas y empresas avícolas comerciales, incluido el Instituto Roslin, Aviagen Ltd, Hy-Line International con fondos de BBSRC LINK y el proyecto alemán Synbreed financiado por BMBF.
Esta matriz de genotipado detecta variantes genéticas en ponedoras de huevos blancos, ponedoras de huevos marrones, pollos de engorde y razas no comerciales exógamas. La información de alta densidad de los padres de la matriz es útil para la cría de aves de corral, mientras que los marcadores asociados con líneas cruzadas silvestres son útiles para el análisis de la diversidad genética entre las poblaciones de pollos autóctonos.
Características y beneficios de Axiom Chicken Genotyping Array:
• Contenido completo: más de 580,000 marcadores comunes y raros seleccionados de 1.8 millones de variantes probadas
• Cobertura de todo el genoma : marcadores bien anotados distribuidos uniformemente en todo el genoma en ponedoras y pollos de engorde
• Diseñado para su raza: más de 24 razas representadas, incluidas ponedoras comerciales y pollos de engorde y líneas exógamas no comerciales
• Asequible: alto retorno de la inversión y el más bajo disponible coste por marcador
• rendimiento del ensayo robusto: Incluye SNPs genotipo probado que son altamente polimórficos y demuestran a> 99% de tasa de llamadas
Aplicaciones de Axiom pollo Genotipado de matriz:
• todo el genoma estudios de asociación
• alta resolución genética mapeo
• mendeliana rasgo de mapeo
•Análisis de diversidad en pollos autóctonos
• Análisis de firma de selección
