En Genexa contamos con la primer plataforma a nivel local para el genotipado de mediana o alta densidad de marcadores de tipo SNP de la firma ThermoFisher.

La plataforma GeneTitan, Affymetrix permite analizar miles de sitios en el genoma a través de microarreglos comerciales para diferentes aplicaciones.

En Agrigenómica las principales aplicaciones son:

Array Porcino

Applied Biosystems Axiom Porcine Breeders Array incluye marcadores centrados en la selección genómica de razas porcinas comerciales, incluidas Large White, Landrace, Duroc y Pietrain. Los marcadores centrales para la matriz se seleccionaron a partir de marcadores en la matriz de alta densidad porcina Axiom que se evaluaron utilizando muestras de múltiples razas comerciales y domésticas, incluidos los jabalíes europeos. La inclusión de los marcadores más informativos y de mejor rendimiento de las matrices porcinas existentes garantiza que esta matriz se pueda utilizar para comparar con los datos generados por estudios anteriores. Con la disponibilidad de la herramienta de exportación de formato largo Axiom, que convierte los datos de la matriz Axiom en formato largo, la matriz también brinda la capacidad de continuar con los proyectos existentes sin cambios en la infraestructura y la cartera de bioinformática actual.

Las características incluyen:
• 55,150 marcadores para la selección genómica y de rasgos
• 42 marcadores específicos de rasgos seleccionados por el Departamento de Agricultura de los Estados Unidos
• 64 marcadores de parentesco, incluidos los marcadores centrales de ISAG
• SNP distribuidos uniformemente en todo el genoma porcino
• Anotaciones de marcadores alineadas con Sscrofa10.2 / susScr3 genoma y dbSNP 148
• apuntado para razas comerciales incluyendo Large White, Landrace, Duroc y Pietrain

Aplicaciones
• análisis de parentesco
• identificación de las características de importancia económica
• mejora genética de líneas puras

https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/550855?SID=srch-srp-550855#/550855?SID=srch-srp-550855